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SynerClust: a highly scalable, synteny-aware orthologue clustering tool

Accurate orthologue identification is a vital component of bacterial comparative genomic studies, but many popular sequence-similarity-based approaches do not scale well to the large numbers of genomes that are now generated routinely. Furthermore, most approaches do not take gene synteny into accou...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Microb Genom
Hauptverfasser: Georgescu, Christophe H., Manson, Abigail L., Griggs, Alexander D., Desjardins, Christopher A., Pironti, Alejandro, Wapinski, Ilan, Abeel, Thomas, Haas, Brian J., Earl, Ashlee M.
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Microbiology Society 2018
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6321874/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30418868
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.000231
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