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AbsCN-seq: a statistical method to estimate tumor purity, ploidy and absolute copy numbers from next-generation sequencing data

Motivation: Detection and quantification of the absolute DNA copy number alterations in tumor cells is challenging because the DNA specimen is extracted from a mixture of tumor and normal stromal cells. Estimates of tumor purity and ploidy are necessary to correctly infer copy number, and ploidy may...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Bioinformatics
Hauptverfasser: Bao, Lei, Pu, Minya, Messer, Karen
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Oxford University Press 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6280749/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24389661
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btt759
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