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CLIP Tool Kit (CTK): a flexible and robust pipeline to analyze CLIP sequencing data

SUMMARY: UV cross-linking and immunoprecipitation (CLIP), followed by high-throughput sequencing, is a powerful biochemical assay that maps in vivo protein-RNA interactions on a genome-wide scale. The CLIP Tool Kit (CTK) aims at providing a set of tools for flexible, streamlined and comprehensive CL...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Bioinformatics
Hauptverfasser: Shah, Ankeeta, Qian, Yingzhi, Weyn-Vanhentenryck, Sebastien M, Zhang, Chaolin
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Oxford University Press 2017
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6041811/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27797762
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw653
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