Загрузка...

On the (im)possibility of reconstructing plasmids from whole-genome short-read sequencing data

To benchmark algorithms for automated plasmid sequence reconstruction from short-read sequencing data, we selected 42 publicly available complete bacterial genome sequences spanning 12 genera, containing 148 plasmids. We predicted plasmids from short-read data with four programs (PlasmidSPAdes, Recy...

Полное описание

Сохранить в:
Библиографические подробности
Опубликовано в: :Microb Genom
Главные авторы: Arredondo-Alonso, Sergio, Willems, Rob J., van Schaik, Willem, Schürch, Anita C.
Формат: Artigo
Язык:Inglês
Опубликовано: Microbiology Society 2017
Предметы:
Online-ссылка:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5695206/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29177087
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.000128
Метки: Добавить метку
Нет меток, Требуется 1-ая метка записи!