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An annotation agnostic algorithm for detecting nascent RNA transcripts in GRO-seq

We present a fast and simple algorithm to detect nascent RNA transcription in global nuclear run-on sequencing (GRO-seq). GRO-seq is a relatively new protocol that captures nascent transcripts from actively engaged polymerase, providing a direct read-out on bona fide transcription. Most traditional...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
Main Authors: Azofeifa, Joseph G., Allen, Mary A., Lladser, Manuel E., Dowell, Robin D.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2016
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5667649/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26829802
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1109/TCBB.2016.2520919
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