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Traversing the k-mer Landscape of NGS Read Datasets for Quality Score Sparsification

It is becoming increasingly impractical to indefinitely store raw sequencing data for later processing in an uncompressed state. In this paper, we describe a scalable compressive framework, Read-Quality-Sparsifier (RQS), which substantially outperforms the compression ratio and speed of other de nov...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Res Comput Mol Biol
Hauptverfasser: Yu, Y. William, Yorukoglu, Deniz, Berger, Bonnie
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5558603/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28825060
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-05269-4_31
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