Hybrid assembly with long and short reads improves discovery of gene family expansions

BACKGROUND: Long-read and short-read sequencing technologies offer competing advantages for eukaryotic genome sequencing projects. Combinations of both may be appropriate for surveys of within-species genomic variation. METHODS: We developed a hybrid assembly pipeline called “Alpaca” that can operat...

תיאור מלא

שמור ב:
מידע ביבליוגרפי
הוצא לאור ב:BMC Genomics
Main Authors: Miller, Jason R., Zhou, Peng, Mudge, Joann, Gurtowski, James, Lee, Hayan, Ramaraj, Thiruvarangan, Walenz, Brian P., Liu, Junqi, Stupar, Robert M., Denny, Roxanne, Song, Li, Singh, Namrata, Maron, Lyza G., McCouch, Susan R., McCombie, W. Richard, Schatz, Michael C., Tiffin, Peter, Young, Nevin D., Silverstein, Kevin A. T.
פורמט: Artigo
שפה:Inglês
יצא לאור: BioMed Central 2017
נושאים:
Methodology Article
גישה מקוונת:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5518131/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28724409
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s12864-017-3927-8
תגים: הוספת תג
אין תגיות, היה/י הראשונ/ה לתייג את הרשומה!

פריטים דומים