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SynthEx: a synthetic-normal-based DNA sequencing tool for copy number alteration detection and tumor heterogeneity profiling

Changes in the quantity of genetic material, known as somatic copy number alterations (CNAs), can drive tumorigenesis. Many methods exist for assessing CNAs using microarrays, but considerable technical issues limit current CNA calling based upon DNA sequencing. We present SynthEx, a novel tool for...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Main Authors: Silva, Grace O., Siegel, Marni B., Mose, Lisle E., Parker, Joel S., Sun, Wei, Perou, Charles M., Chen, Mengjie
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2017
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5385048/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28390427
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-017-1193-3
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