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PIPE-chipSAD: A Pipeline for the Analysis of High Density Arrays of Bacterial Transcriptomes

PIPE-chipSAD is a pipeline for bacterial transcriptome studies based on high-density microarray experiments. The main algorithm chipSAD, integrates the analysis of the hybridization signal with the genomic position of probes and identifies portions of the genome transcribing for mRNAs. The pipeline...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Front Mol Biosci
Hauptverfasser: Bottini, Silvia, Del Tordello, Elena, Fagnocchi, Luca, Donati, Claudio, Muzzi, Alessandro
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Frontiers Media S.A. 2016
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5167695/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28066774
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2016.00082
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