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Spectacle: fast chromatin state annotation using spectral learning

Epigenomic data from ENCODE can be used to associate specific combinations of chromatin marks with regulatory elements in the human genome. Hidden Markov models and the expectation-maximization (EM) algorithm are often used to analyze epigenomic data. However, the EM algorithm can have overfitting p...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Main Authors: Song, Jimin, Chen, Kevin C
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2015
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4355146/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25786205
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0598-0
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