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MULTIPLE TESTING OF LOCAL MAXIMA FOR DETECTION OF PEAKS IN CHIP-SEQ DATA

A topological multiple testing approach to peak detection is proposed for the problem of detecting transcription factor binding sites in ChIP-Seq data. After kernel smoothing of the tag counts over the genome, the presence of a peak is tested at each observed local maximum, followed by multiple test...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Ann Appl Stat
Main Authors: Schwartzman, Armin, Jaffe, Andrew, Gavrilov, Yulia, Meyer, Clifford A.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2013
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4233463/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25411587
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