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cgDNA: a software package for the prediction of sequence-dependent coarse-grain free energies of B-form DNA

cgDNA is a package for the prediction of sequence-dependent configuration-space free energies for B-form DNA at the coarse-grain level of rigid bases. For a fragment of any given length and sequence, cgDNA calculates the configuration of the associated free energy minimizer, i.e. the relative positi...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Nucleic Acids Res
Hauptverfasser: Petkevičiūtė, D., Pasi, M., Gonzalez, O., Maddocks, J.H.
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Oxford University Press 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4227758/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25228467
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/nar/gku825
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