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Efficient algorithms for the discovery of gapped factors

BACKGROUND: The discovery of surprisingly frequent patterns is of paramount interest in bioinformatics and computational biology. Among the patterns considered, those consisting of pairs of solid words that co-occur within a prescribed maximum distance -or gapped factors- emerge in a variety of cont...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Apostolico, Alberto, Pizzi, Cinzia, Ukkonen, Esko
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2011
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3080308/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21429203
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/1748-7188-6-5
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