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Optimizing Data Intensive GPGPU Computations for DNA Sequence Alignment

MUMmerGPU uses highly-parallel commodity graphics processing units (GPU) to accelerate the data-intensive computation of aligning next generation DNA sequence data to a reference sequence for use in diverse applications such as disease genotyping and personal genomics. MUMmerGPU 2.0 features a new s...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Trapnell, Cole, Schatz, Michael C.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2009
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2749273/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20161021
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1016/j.parco.2009.05.002
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