Inferring protein domain interactions from databases of interacting proteins

We describe domain pair exclusion analysis (DPEA), a method for inferring domain interactions from databases of interacting proteins. DPEA features a log odds score, E(ij), reflecting confidence that domains i and j interact. We analyzed 177,233 potential domain interactions underlying 26,032 protei...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Riley, Robert, Lee, Christopher, Sabatti, Chiara, Eisenberg, David
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2005
Assuntos:
Method
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1257472/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16207360
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/gb-2005-6-10-r89
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