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Asymptotic behaviour and optimal word size for exact and approximate word matches between random sequences

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The number of <it>k</it>-words shared between two sequences is a simple and effcient alignment-free sequence comparison method. This statistic, <it>D</it><sub>2</sub>, has been used for the cluster...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Kantorovitz Miriam R, Forêt Sylvain, Burden Conrad J
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2006-12-01
Colecção:BMC Bioinformatics
Acesso em linha:http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-7-S5-S21
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