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Uncovering the multi-layer cis-regulatory landscape of rice via integrative nascent RNA analysis

Abstract Background Efforts to characterize regulatory elements in plant genomes traditionally rely on evolutionary conservation and chromatin accessibility. Recently, intergenic bi-directional nascent transcript has emerged as a putative hallmark of active enhancers. Here, we integrate these approa...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Marina Goliasse, Aurore Johary, Adrian E. Platts, Fabian Ortner-Krause, Patrick P. Edger, Jae Young Choi, Michael D. Purugganan, Zoé Joly-Lopez
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2025-08-01
Colecção:Genome Biology
Assuntos:
Acesso em linha:https://doi.org/10.1186/s13059-025-03715-2
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