scHolography: a computational method for single-cell spatial neighborhood reconstruction and analysis

Abstract Spatial transcriptomics has transformed our ability to study tissue complexity. However, it remains challenging to accurately dissect tissue organization at single-cell resolution. Here we introduce scHolography, a machine learning-based method designed to reconstruct single-cell spatial ne...

Szczegółowa specyfikacja

Opis bibliograficzny

Główni autorzy:	Yuheng C. Fu, Arpan Das, Dongmei Wang, Rosemary Braun, Rui Yi
Format:	Artigo
Język:	Inglês
Wydane:	BMC 2024-06-01
Seria:	Genome Biology
Hasła przedmiotowe:	Single-cell spatial transcriptomics Spatial neighborhood analysis Neural network Deep learning Stable matching neighbor
Dostęp online:	https://doi.org/10.1186/s13059-024-03299-3
Etykiety:	Dodaj etykietę Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!