Comparing alignment and de-novo approaches for gut microbiota metagenomic data analysis reveals differences in taxonomic resolution and novel functional insights

Abstract Microbiome annotation based on metagenomic data is primarily conducted using two global approaches: alignment-based approach (AL) and de novo approach (DN). This study aimed to evaluate the limitations of each approach, explore correlations between their results, and assess the equivalence...

Szczegółowa specyfikacja

Opis bibliograficzny

Główni autorzy:	Polina Kuzmichenko, Dmitry Fedorov, Julia Galeeva, Anna Postoeva, Ekaterina Krieger, Alexander Kudryavtsev, Alexander Pavlenko, Andrey Vvedensky, Elizaveta Starikova, Vadim Govorun, Elena Ilina
Format:	Artigo
Język:	Inglês
Wydane:	Nature Portfolio 2025-11-01
Seria:	Scientific Reports
Hasła przedmiotowe:	Microbiome de-novo assembly Alignment,2,5-diketo-D-gluconate reductase A Alistipes onderdonkii
Dostęp online:	https://doi.org/10.1038/s41598-025-26617-6
Etykiety:	Dodaj etykietę Nie ma etykietki, Dołącz pierwszą etykiete!