Impact of DNA extraction, PCR amplification, sequencing, and bioinformatic analysis on food-associated mock communities using PacBio long-read amplicon sequencing

Abstract Background Long-read 16S rRNA gene amplicon sequencing has a high potential for characterizing food-associated microbiomes. The advantage results from sequencing the full-length (1,500 bp) gene, enabling taxonomic resolution at species level. Here we present a benchmarking study using mock...

وصف كامل

التفاصيل البيبلوغرافية

المؤلفون الرئيسيون:	Mareike Baer, Lisa Höppe, Waldemar Seel, André Lipski
التنسيق:	Artigo
اللغة:	Inglês
منشور في:	BMC 2024-12-01
سلاسل:	BMC Microbiology
الموضوعات:	PacBio sequencing Full-length 16S rRNA gene Long-read sequencing Amplicon sequencing Mock community Food microbiota
الوصول للمادة أونلاين:	https://doi.org/10.1186/s12866-024-03677-8
الوسوم:	إضافة وسم لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!