Repurposing approved drugs as inhibitors of SARS-CoV-2 S-protein from molecular modeling and virtual screening

por de Oliveira, Osmair Vital, Rocha, Gerd B., Paluch, Andrew S., Costa, Luciano T.
Publicado en J Biomol Struct Dyn (2020)

Semiempirical Quantum Chemistry Model for the Lanthanides: RM1 (Recife Model 1) Parameters for Dysprosium, Holmium and Erbium

por Filho, Manoel A. M., Dutra, José Diogo L., Rocha, Gerd B., Simas, Alfredo M., Freire, Ricardo O.
Publicado 2014

RM1 Semiempirical Quantum Chemistry: Parameters for Trivalent Lanthanum, Cerium and Praseodymium

por Dutra, José Diogo L., Filho, Manoel A. M., Rocha, Gerd B., Simas, Alfredo M., Freire, Ricardo O.
Publicado en PLoS One (2015)

Parameters for the RM1 Quantum Chemical Calculation of Complexes of the Trications of Thulium, Ytterbium and Lutetium

por Filho, Manoel A. M., Dutra, José Diogo L., Rocha, Gerd B., Simas, Alfredo M., Freire, Ricardo O.
Publicado en PLoS One (2016)

Sparkle/PM7 Lanthanide Parameters for the Modeling of Complexes and Materials

por Dutra, José Diogo L., Filho, Manoel A. M., Rocha, Gerd B., Freire, Ricardo O., Simas, Alfredo M., Stewart, James J. P.
Publicado 2013

NAMD goes quantum: An integrative suite for QM/MM simulations

por Melo, Marcelo C. R., Bernardi, Rafael C., Rudack, Till, Scheurer, Maximilian, Riplinger, Christoph, Phillips, James C., Maia, Julio D. C., Rocha, Gerd B., Ribeiro, João V., Stone, John E., Neese, Frank, Schulten, Klaus, Luthey-Schulten, Zaida
Publicado en Nat Methods (2018)

A higher flexibility at the SARS-CoV-2 main protease active site compared to SARS-CoV and its potentialities for new inhibitor virtual screening targeting multi-conformers

por Rocha, Rafael E. O., Chaves, Elton J. F., Fischer, Pedro H. C., Costa, Leon S. C., Grillo, Igor Barden, da Cruz, Luiz E. G., Guedes, Fabiana C., da Silveira, Carlos H., Scotti, Marcus T., Camargo, Alex D., Machado, Karina S., Werhli, Adriano V., Ferreira, Rafaela S., Rocha, Gerd B., de Lima, Leonardo H. F.
Publicado en J Biomol Struct Dyn (2021)