Computational classification of MocR transcriptional regulators into subgroups as a support for experimental and functional characterization

Bằng Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Bioinformation (2019)

Structural mimicry between SLA/LP and Rickettsia surface antigens as a driver of autoimmune hepatitis: insights from an in silico study

Bằng Paiardini, Alessandro, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2013

CAMPO, SCR_FIND and CHC_FIND: a suite of web tools for computational structural biology

Bằng Paiardini, Alessandro, Bossa, Francesco, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2005

Evolutionarily conserved regions and hydrophobic contacts at the superfamily level: The case of the fold-type I, pyridoxal-5′-phosphate-dependent enzymes

Bằng Paiardini, Alessandro, Bossa, Francesco, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2004

Conformational transitions induced by γ-amino butyrate binding in GabR, a bacterial transcriptional regulator

Bằng Frezzini, Mario, Guidoni, Leonardo, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Sci Rep (2019)

"Hot cores" in proteins: Comparative analysis of the apolar contact area in structures from hyper/thermophilic and mesophilic organisms

Bằng Paiardini, Alessandro, Sali, Riccardo, Bossa, Francesco, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2008

Structural adaptation of extreme halophilic proteins through decrease of conserved hydrophobic contact surface

Bằng Siglioccolo, Alessandro, Paiardini, Alessandro, Piscitelli, Maria, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2011

PyMod: sequence similarity searches, multiple sequence-structure alignments, and homology modeling within PyMOL

Bằng Bramucci, Emanuele, Paiardini, Alessandro, Bossa, Francesco, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2012

Type I pyridoxal 5′-phosphate dependent enzymatic domains embedded within multimodular nonribosomal peptide synthetase and polyketide synthase assembly lines

Bằng Milano, Teresa, Paiardini, Alessandro, Grgurina, Ingeborg, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2013

SARS-Cov-2 ORF3a: Mutability and function

Bằng Bianchi, Martina, Borsetti, Alessandra, Ciccozzi, Massimo, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Int J Biol Macromol (2021)

Serine Hydroxymethyltransferase from the Cold Adapted Microorganism Psychromonas ingrahamii: A Low Temperature Active Enzyme with Broad Substrate Specificity

Bằng Angelaccio, Sebastiana, Florio, Rita, Consalvi, Valerio, Festa, Guido, Pascarella, Stefano
Được phát hành 2012

Molecular dynamics simulation unveils the conformational flexibility of the interdomain linker in the bacterial transcriptional regulator GabR from Bacillus subtilis bound to pyrid...

Bằng Milano, Teresa, Gulzar, Adnan, Narzi, Daniele, Guidoni, Leonardo, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm PLoS One (2017)

COVID‐2019: The role of the nsp2 and nsp3 in its pathogenesis

Bằng Angeletti, Silvia, Benvenuto, Domenico, Bianchi, Martina, Giovanetti, Marta, Pascarella, Stefano, Ciccozzi, Massimo
Xuất bản năm J Med Virol (2020)

Sars-CoV-2 Envelope and Membrane Proteins: Structural Differences Linked to Virus Characteristics?

Bằng Bianchi, Martina, Benvenuto, Domenico, Giovanetti, Marta, Angeletti, Silvia, Ciccozzi, Massimo, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Biomed Res Int (2020)

Response to Ribeiro da Silva et al,“Role of nonstructural proteins in the pathogenesis of SARS‐CoV‐2”

Bằng Ciccozzi, Massimo, Benvenuto, Domenico, Giovanetti, Marta, Bianchi, Martina, Pascarella, Stefano, Angeletti, Silvia
Xuất bản năm J Med Virol (2020)

A Bioinformatics Analysis Reveals a Group of MocR Bacterial Transcriptional Regulators Linked to a Family of Genes Coding for Membrane Proteins

Bằng Milano, Teresa, Angelaccio, Sebastiana, Tramonti, Angela, Di Salvo, Martino Luigi, Contestabile, Roberto, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Biochem Res Int (2016)

Data from computational analysis of the peptide linkers in the MocR bacterial transcriptional regulators

Bằng Angelaccio, Sebastiana, Milano, Teresa, Tramonti, Angela, Di Salvo, Martino Luigi, Contestabile, Roberto, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Data Brief (2016)

Structural properties of the linkers connecting the N- and C- terminal domains in the MocR bacterial transcriptional regulators

Bằng Milano, Teresa, Angelaccio, Sebastiana, Tramonti, Angela, Di Salvo, Martino Luigi, Contestabile, Roberto, Pascarella, Stefano
Xuất bản năm Biochim Open (2016)

Evolutionary analysis of SARS-CoV-2: how mutation of Non-Structural Protein 6 (NSP6) could affect viral autophagy

Bằng Benvenuto, Domenico, Angeletti, Silvia, Giovanetti, Marta, Bianchi, Martina, Pascarella, Stefano, Cauda, Roberto, Ciccozzi, Massimo, Cassone, Antonio
Xuất bản năm J Infect (2020)

Evidence for mutations in SARS‐CoV‐2 Italian isolates potentially affecting virus transmission

Bằng Benvenuto, Domenico, Demir, Ayse Banu, Giovanetti, Marta, Bianchi, Martina, Angeletti, Silvia, Pascarella, Stefano, Cauda, Roberto, Ciccozzi, Massimo, Cassone, Antonio
Xuất bản năm J Med Virol (2020)