JACOP: A simple and robust method for the automated classification of protein sequences with modular architecture

Bằng Sperisen, Peter, Pagni, Marco
Được phát hành 2005

HitKeeper, a generic software package for hit list management

Bằng Hau, Jörg, Muller, Michael, Pagni, Marco
Được phát hành 2007

Complete Genome Sequence of the Dog Commensal and Human Pathogen Capnocytophaga canimorsus Strain 5

Bằng Manfredi, Pablo, Pagni, Marco, Cornelis, Guy R.
Được phát hành 2011

De Novo Assembly of the Pneumocystis jirovecii Genome from a Single Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimen from a Patient

Bằng Cissé, Ousmane H., Pagni, Marco, Hauser, Philippe M.
Được phát hành 2012

Comparative Genomics Suggests That the Human Pathogenic Fungus Pneumocystis jirovecii Acquired Obligate Biotrophy through Gene Loss

Bằng Cissé, Ousmane H., Pagni, Marco, Hauser, Philippe M.
Được phát hành 2014

MetaNetX.org: a website and repository for accessing, analysing and manipulating metabolic networks

Bằng Ganter, Mathias, Bernard, Thomas, Moretti, Sébastien, Stelling, Joerg, Pagni, Marco
Được phát hành 2013

Swiss EMBnet node web server

Bằng Falquet, Laurent, Bordoli, Lorenza, Ioannidis, Vassilios, Pagni, Marco, Jongeneel, C. Victor
Được phát hành 2003

MetaNetX/MNXref: unified namespace for metabolites and biochemical reactions in the context of metabolic models

Bằng Moretti, Sébastien, Tran, Van Du T, Mehl, Florence, Ibberson, Mark, Pagni, Marco
Xuất bản năm Nucleic Acids Res (2020)

trEST, trGEN and Hits: access to databases of predicted protein sequences

Bằng Pagni, Marco, Iseli, Christian, Junier, Thomas, Falquet, Laurent, Jongeneel, Victor, Bucher, Philipp
Được phát hành 2001

The Microbe browser for comparative genomics

Bằng Gattiker, Alexandre, Dessimoz, Christophe, Schneider, Adrian, Xenarios, Ioannis, Pagni, Marco, Rougemont, Jacques
Được phát hành 2009

pfsearchV3: a code acceleration and heuristic to search PROSITE profiles

Bằng Schuepbach, Thierry, Pagni, Marco, Bridge, Alan, Bougueleret, Lydie, Xenarios, Ioannis, Cerutti, Lorenzo
Được phát hành 2013

Reconciliation of metabolites and biochemical reactions for metabolic networks

Bằng Bernard, Thomas, Bridge, Alan, Morgat, Anne, Moretti, Sébastien, Xenarios, Ioannis, Pagni, Marco
Được phát hành 2014

Population genomics reveals that within-fungus polymorphism is common and maintained in populations of the mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis

Bằng Wyss, Tania, Masclaux, Frédéric G, Rosikiewicz, Pawel, Pagni, Marco, Sanders, Ian R
Xuất bản năm ISME J (2016)

Investigating unexplained genetic variation and its expression in the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis: A comparison of whole genome and RAD sequencing data

Bằng Masclaux, Frédéric G., Wyss, Tania, Pagni, Marco, Rosikiewicz, Pawel, Sanders, Ian R.
Xuất bản năm PLoS One (2019)

MetaNetX/MNXref – reconciliation of metabolites and biochemical reactions to bring together genome-scale metabolic networks

Bằng Moretti, Sébastien, Martin, Olivier, Van Du Tran, T., Bridge, Alan, Morgat, Anne, Pagni, Marco
Xuất bản năm Nucleic Acids Res (2016)

trome, trEST and trGEN: databases of predicted protein sequences

Bằng Sperisen, Peter, Iseli, Christian, Pagni, Marco, Stevenson, Brian J., Bucher, Philipp, Jongeneel, C. Victor
Được phát hành 2004

MyHits: a new interactive resource for protein annotation and domain identification

Bằng Pagni, Marco, Ioannidis, Vassilios, Cerutti, Lorenzo, Zahn-Zabal, Monique, Jongeneel, C. Victor, Falquet, Laurent
Được phát hành 2004

Microbiota Present in Cystic Fibrosis Lungs as Revealed by Whole Genome Sequencing

Bằng Hauser, Philippe M., Bernard, Thomas, Greub, Gilbert, Jaton, Katia, Pagni, Marco, Hafen, Gaudenz M.
Được phát hành 2014

RNA Enrichment Method for Quantitative Transcriptional Analysis of Pathogens In Vivo Applied to the Fungus Candida albicans

Bằng Amorim-Vaz, Sara, Tran, Van Du T., Pradervand, Sylvain, Pagni, Marco, Coste, Alix T., Sanglard, Dominique
Xuất bản năm mBio (2015)

Mechanisms of Surface Antigenic Variation in the Human Pathogenic Fungus Pneumocystis jirovecii

Bằng Schmid-Siegert, Emanuel, Richard, Sophie, Luraschi, Amanda, Mühlethaler, Konrad, Pagni, Marco, Hauser, Philippe M.
Xuất bản năm mBio (2017)