Simplifier: a web tool to eliminate redundant NGS contigs

Por Ramos, Rommel Thiago Jucá, Carneiro, Adriana Ribeiro, Azevedo, Vasco, Schneider, Maria Paula, Barh, Debmalya, Silva, Artur
Publicado em 2012

Tips and tricks for the assembly of a Corynebacterium pseudotuberculosis genome using a semiconductor sequencer

Por Ramos, Rommel Thiago Jucá, Carneiro, Adriana Ribeiro, Soares, Siomar de Castro, dos Santos, Anderson Rodrigues, Almeida, Sintia, Guimarães, Luis, Figueira, Flávia, Barbosa, Eudes, Tauch, Andreas, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado em 2013

Draft Genome Sequence of Mycobacterium abscessus subsp. bolletii INCQS 00594

Por Leão, Sylvia Cardoso, Matsumoto, Cristianne Kayoko, Viana-Niero, Cristina, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Carneiro, Adriana Ribeiro, Barbosa, Maria Silvanira, Lima, Karla Valéria Batista, Lopes, Maria Luiza, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado em 2013

Draft Genome Sequence of Serratia fonticola LMG 7882(T) Isolated from Freshwater

Por Carneiro, Adriana Ribeiro, Jucá Ramos, Rommel Thiago, Baraúna, Rafael Azevedo, de Sá, Pablo Henrique, Marinho Almeida, Diogo, Barbosa, Silvanira, Pereira, Anabela, Alves, Artur, Egas, Conceição, Correia, António, Henriques, Isabel, Silva, Artur
Publicado em 2013

Draft genome sequence of Psychrobacter sp. ENNN9_III, a strain isolated from water in a polluted temperate estuarine system (Ria de Aveiro, Portugal)

Por Gomes, Jaqueline Conceição Meireles, Azevedo, Juliana Simão Nina de, Veras, Adonney Allan de Oliveira, Alves, Jorianne Thyeska Castro, Henriques, Isabel, Correia, António, Silva, Artur Luiz da Costa da, Carneiro, Adriana Ribeiro
Publicado no Genom Data (2016)

Draft Genome Sequence of Serratia fonticola UTAD54, a Carbapenem-Resistant Strain Isolated from Drinking Water

Por Henriques, Isabel, Jucá Ramos, Rommel Thiago, Baraúna, Rafael Azevedo, de Sá, Pablo Henrique, Marinho Almeida, Diogo, Carneiro, Adriana Ribeiro, Barbosa, Silvanira, Pereira, Anabela, Alves, Artur, Saavedra, Maria José, Egas, Conceição, Silva, Artur, Correia, António
Publicado em 2013

Draft Genome Sequence of Corynebacterium ulcerans FRC58, Isolated from the Bronchitic Aspiration of a Patient in France

Por Silva, Andréia do Socorro de Sousa, Baraúna, Rafael Azevedo, de Sá, Pablo Caracciolo Gomes, das Graças, Diego Assis, Carneiro, Adriana Ribeiro, Thouvenin, Maxime, Azevedo, Vasco, Badell, Edgar, Guiso, Nicole, da Silva, Artur Luiz da Costa, Ramos, Rommel Thiago Jucá
Publicado em 2014

Draft Genome Sequence of Methylobacterium mesophilicum Strain SR1.6/6, Isolated from Citrus sinensis

Por Marinho Almeida, Diogo, Dini-Andreote, Francisco, Camargo Neves, Aline Aparecida, Jucá Ramos, Rommel Thiago, Andreote, Fernando Dini, Carneiro, Adriana Ribeiro, Oliveira de Souza Lima, André, Caracciolo Gomes de Sá, Pablo Henrique, Ribeiro Barbosa, Maria Silvanira, Araújo, Welington Luiz, Silva, Artur
Publicado em 2013

Ion Torrent-based transcriptional assessment of a Corynebacterium pseudotuberculosis equi strain reveals denaturing high-performance liquid chromatography a promising rRNA depletio...

Por Castro, Thiago L P, Seyffert, Nubia, Ramos, Rommel T J, Barbosa, Silvanira, Carvalho, Rodrigo D O, Pinto, Anne Cybelle, Carneiro, Adriana Ribeiro, Silva, Wanderson Marques, Pacheco, Luis G C, Downson, Christopher, Schneider, Maria P C, Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado em 2013

Draft Genome Sequence of Non-O1 and Non-O139 Vibrio cholerae Strain VCC19

Por de Sá, Pablo Caracciolo Gomes, Da Silva, Miriam Lopes, Carneiro, Adriana Ribeiro, Gomes, Jaqueline Conceição Meireles, Dias, Larissa Maranhão, Alves, Jorianne Thyeska Castro, De Oliveira Veras, Adonney Allan, Baraúna, Rafael Azevedo, Das Graças, Diego Assis, Matté, Maria Helena, Sato, Maria Ines Zanolli, Hachich, Elayse Maria, Matté, Glavur Rogério, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Silva, Artur
Publicado no Genome Announc (2014)

Genome Sequence of the Corynebacterium pseudotuberculosis Cp316 Strain, Isolated from the Abscess of a Californian Horse

Por Ramos, Rommel Thiago Jucá, Silva, Artur, Carneiro, Adriana Ribeiro, Pinto, Anne Cybelle, Soares, Siomar de Castro, Santos, Anderson Rodrigues, Almeida, Sintia Silva, Guimarães, Luis Carlos, Aburjaile, Flávia Figueira, Barbosa, Eudes Guilherme Vieira, Dorella, Fernanda Alves, Rocha, Flávia Souza, Cerdeira, Louise Teixeira, Barbosa, Maria Silvanira, Tauch, Andreas, Edman, Judy, Spier, Sharon, Miyoshi, Anderson, Schneider, Maria Paula Cruz, Azevedo, Vasco
Publicado em 2012

Draft Genome Sequences of Two Pathogenic Corynebacterial Species Isolated from Cows

Por Guimarães, Luis Carlos, Lopes, Thiago, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Carneiro, Adriana Ribeiro, Cavalcante, Ana Lídia Queiroz, Barreto, Diego, de Sá, Pablo Caracciolo Gomes, Veras, Adonney Allan Oliveira, Rocha, Flávia Souza, Bagano, Priscilla, Pereira, Felipe Luiz, Dorella, Fernanda Alves, Leal, Carlos Augusto, Carvalho, Alex Fiorini, Bizet, Chantal, Guiso, Nicole, Badell, Edgar, Figueiredo, Henrique César Pereira, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado no J Genomics (2016)

Draft Genome Sequences of Vibrio fluvialis Strains 560 and 539, Isolated from Environmental Samples

Por de Oliveira Veras, Adonney Allan, da Silva, Miriam Lopes, Gomes, Jaqueline Conceição Meireles, Dias, Larissa Maranhão, de Sá, Pablo Caracciolo Gomes, Alves, Jorianne Thyeska Castro, Castro, Wendel, Miranda, Fábio, Kazuo, Ehilton, Marinho, Diogo, Rodrigues, Mateus, Freire, Matheus, Zahlouth, Ramiro, Renan, Wendel, Lopes, Thiago Souza, Matté, Maria Helena, da Silva Mayer, Cintia Carolina, de Almeida Vasconcelos Barboni, Suzi, Matté, Glavur Rogério, Carneiro, Adriana Ribeiro, Silva, Artur, Ramos, Rommel Thiago Jucá
Publicado no Genome Announc (2015)

Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina

Por Cerdeira, Louise Teixeira, Pinto, Anne Cybelle, Schneider, Maria Paula Cruz, de Almeida, Sintia Silva, dos Santos, Anderson Rodrigues, Barbosa, Eudes Guilherme Vieira, Ali, Amjad, Barbosa, Maria Silvanira, Carneiro, Adriana Ribeiro, Ramos, Rommel Thiago Jucá, de Oliveira, Rodrigo Santos, Barh, Debmalya, Barve, Neha, Zambare, Vasudeo, Belchior, Silvia Estevão, Guimarães, Luis Carlos, de Castro Soares, Siomar, Dorella, Fernanda Alves, Rocha, Flavia Souza, de Abreu, Vinicius Augusto Carvalho, Tauch, Andreas, Trost, Eva, Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado em 2011

Complete genome sequence of Streptococcus agalactiae strain SA20-06, a fish pathogen associated to meningoencephalitis outbreaks

Por Pereira, Ulisses de Pádua, Rodrigues dos Santos, Anderson, Hassan, Syed Shah, Aburjaile, Flávia Figueira, Soares, Siomar de Castro, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Carneiro, Adriana Ribeiro, Guimarães, Luís Carlos, Silva de Almeida, Sintia, Diniz, Carlos Augusto Almeida, Barbosa, Maria Silvanira, Gomes de Sá, Pablo, Ali, Amjad, Bakhtiar, Syeda Marriam, Dorella, Fernanda Alves, Zerlotini, Adhemar, Araújo, Flávio Marcos Gomes, Leite, Laura Rabelo, Oliveira, Guilherme, Miyoshi, Anderson, Silva, Artur, Azevedo, Vasco, Figueiredo, Henrique César Pereira
Publicado em 2013

Complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar ovis strain P54B96 isolated from antelope in South Africa obtained by rapid next generation sequencing technol...

Por Hassan, Syed Shah, Guimarães, Luis Carlos, Pereira, Ulisses de Pádua, Islam, Arshad, Ali, Amjad, Bakhtiar, Syeda Marriam, Ribeiro, Dayana, Rodrigues dos Santos, Anderson, Soares, Siomar de Castro, Dorella, Fernanda, Pinto, Anne Cybelle, Schneider, Maria Paula Cruz, Barbosa, Maria Silvanira, Almeida, Síntia, Abreu, Vinícius, Aburjaile, Flávia, Carneiro, Adriana Ribeiro, Cerdeira, Louise Teixeira, Fiaux, Karina, Barbosa, Eudes, Diniz, Carlos, Rocha, Flavia S., Ramos, Rommel Thiago Jucá, Jain, Neha, Tiwari, Sandeep, Barh, Debmalya, Miyoshi, Anderson, Müller, Borna, Silva, Artur, Azevedo, Vasco
Publicado em 2012

Genome Sequence of Exiguobacterium antarcticum B7, Isolated from a Biofilm in Ginger Lake, King George Island, Antarctica

Por Carneiro, Adriana Ribeiro, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Dall'Agnol, Hivana, Pinto, Anne Cybelle, de Castro Soares, Siomar, Santos, Anderson Rodrigues, Guimarães, Luis Carlos, Almeida, Sintia Silva, Baraúna, Rafael Azevedo, das Graças, Diego Assis, Franco, Luciano Chaves, Ali, Amjad, Hassan, Syed Shah, Nunes, Catarina Isabel P., Barbosa, Maria Silvanira, Fiaux, Karina Kelly, Aburjaile, Flávia Figueira, Barbosa, Eudes Guilherme Vieira, Bakhtiar, Syeda Marriam, Vilela, Daniella, Nóbrega, Felipe, dos Santos, Adriana Lopes, Carepo, Marta Sofia P., Azevedo, Vasco, Schneider, Maria Paula Cruz, Pellizari, Vivian Helena, Silva, Artur
Publicado em 2012

Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya

Por Cerdeira, Louise Teixeira, Schneider, Maria Paula Cruz, Pinto, Anne Cybelle, de Almeida, Sintia Silva, dos Santos, Anderson Rodrigues, Barbosa, Eudes Guilherme Vieira, Ali, Amjad, Aburjaile, Flávia Figueira, de Abreu, Vinicius Augusto Carvalho, Guimarães, Luis Carlos, Soares, Siomar de Castro, Dorella, Fernanda Alves, Rocha, Flávia Souza, Bol, Erick, Gomes de Sá, Pablo Henrique Caracciolo, Lopes, Thiago Souza, Barbosa, Maria Silvanira, Carneiro, Adriana Ribeiro, Jucá Ramos, Rommel Thiago, Coimbra, Nilson Antônio da Rocha, Lima, Alex Ranieri Jerônimo, Barh, Debmalya, Jain, Neha, Tiwari, Sandeep, Raja, Rathiram, Zambare, Vasudeo, Ghosh, Preetam, Trost, Eva, Tauch, Andreas, Miyoshi, Anderson, Azevedo, Vasco, Silva, Artur
Publicado em 2011

Complete Genome Sequence of Type Strain Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354(T)

Por Stynen, Ana Paula Reinato, Lage, Andrey Pereira, Moore, Robert J., Rezende, Antonio Mauro, de Resende, Vivian D'Afonseca da Silva, Ruy, Patricia de Cássia, Daher, Nesley, Resende, Daniela de Melo, de Almeida, Sintia Silva, Soares, Siomar de Castro, de Abreu, Vinicius Augusto Carvalho, Rocha, Aryane Aparecida C. Magalhães, dos Santos, Anderson Rodrigues, Barbosa, Eudes Guilherme Vieira, Costa, Danielle Fonseca, Dorella, Fernanda Alves, Miyoshi, Anderson, de Lima, Alex Ranieri Jerônimo, Campos, Frederico Davi da Silva, de Sá, Pablo Gomes, Lopes, Thiago Souza, Rodrigues, Ryan Mauricio Araujo, Carneiro, Adriana Ribeiro, Leão, Thiago, Cerdeira, Louise Teixeira, Ramos, Rommel Thiago Jucá, Silva, Artur, Azevedo, Vasco, Ruiz, Jerônimo C.
Publicado em 2011