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GraphAligner: rapid and versatile sequence-to-graph alignment

Genome graphs can represent genetic variation and sequence uncertainty. Aligning sequences to genome graphs is key to many applications, including error correction, genome assembly, and genotyping of variants in a pangenome graph. Yet, so far, this step is often prohibitively slow. We present GraphA...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Biol
Hauptverfasser: Rautiainen, Mikko, Marschall, Tobias
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: BioMed Central 2020
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7513500/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32972461
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-020-02157-2
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