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gsufsort: constructing suffix arrays, LCP arrays and BWTs for string collections

BACKGROUND: The construction of a suffix array for a collection of strings is a fundamental task in Bioinformatics and in many other applications that process strings. Related data structures, as the Longest Common Prefix array, the Burrows–Wheeler transform, and the document array, are often needed...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Algorithms Mol Biol
Principais autores: Louza, Felipe A., Telles, Guilherme P., Gog, Simon, Prezza, Nicola, Rosone, Giovanna
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7507297/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32973918
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13015-020-00177-y
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