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Comparison of core-genome MLST, coreSNP and PFGE methods for Klebsiella pneumoniae cluster analysis

In this work we compared the most frequently used Klebsiella pneumoniae typing methods: PFGE, cgMLST and coreSNP. We evaluated the discriminatory power of the three methods to confirm or exclude nosocomial transmission on K. pneumoniae strains isolated from January to December 2017, in the framework...

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Pubblicato in:Microb Genom
Autori principali: Gona, Floriana, Comandatore, Francesco, Battaglia, Simone, Piazza, Aurora, Trovato, Alberto, Lorenzin, Giovanni, Cichero, Paola, Biancardi, Anna, Nizzero, Paola, Moro, Matteo, Cirillo, Daniela Maria
Natura: Artigo
Lingua:Inglês
Pubblicazione: Microbiology Society 2020
Soggetti:
Accesso online:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7276701/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32149598
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1099/mgen.0.000347
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