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Hierarchically Labeled Database Indexing Allows Scalable Characterization of Microbiomes

Increasingly available microbial reference data allow interpreting the composition and function of previously uncharacterized microbial communities in detail, via high-throughput sequencing analysis. However, efficient methods for read classification are required when the best database matches for s...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:iScience
Main Authors: Utro, Filippo, Haiminen, Niina, Siragusa, Enrico, Gardiner, Laura-Jayne, Seabolt, Ed, Krishna, Ritesh, Kaufman, James H., Parida, Laxmi
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Elsevier 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7125348/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32248063
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1016/j.isci.2020.100988
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