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Compacta: a fast contig clustering tool for de novo assembled transcriptomes

BACKGROUND: RNA-Seq is the preferred method to explore transcriptomes and to estimate differential gene expression. When an organism has a well-characterized and annotated genome, reads obtained from RNA-Seq experiments can be directly mapped to that genome to estimate the number of transcripts pres...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:BMC Genomics
Main Authors: Razo-Mendivil, Fernando G., Martínez, Octavio, Hayano-Kanashiro, Corina
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7014741/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32046653
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s12864-020-6528-x
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