Benchmarking transposable element annotation methods for creation of a streamlined, comprehensive pipeline

BACKGROUND: Sequencing technology and assembly algorithms have matured to the point that high-quality de novo assembly is possible for large, repetitive genomes. Current assemblies traverse transposable elements (TEs) and provide an opportunity for comprehensive annotation of TEs. Numerous methods e...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Genome Biol
Hauptverfasser: Ou, Shujun, Su, Weija, Liao, Yi, Chougule, Kapeel, Agda, Jireh R. A., Hellinga, Adam J., Lugo, Carlos Santiago Blanco, Elliott, Tyler A., Ware, Doreen, Peterson, Thomas, Jiang, Ning, Hirsch, Candice N., Hufford, Matthew B.
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: BioMed Central 2019
Schlagworte:
Research
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6913007/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31843001
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1905-y
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Ähnliche Einträge