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HMMRATAC: a Hidden Markov ModeleR for ATAC-seq

ATAC-seq has been widely adopted to identify accessible chromatin regions across the genome. However, current data analysis still utilizes approaches initially designed for ChIP-seq or DNase-seq, without considering the transposase digested DNA fragments that contain additional nucleosome positionin...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Nucleic Acids Res
Main Authors: Tarbell, Evan D, Liu, Tao
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2019
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6895260/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31199868
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz533
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