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ChiCMaxima: a robust and simple pipeline for detection and visualization of chromatin looping in Capture Hi-C

Capture Hi-C (CHi-C) is a new technique for assessing genome organization based on chromosome conformation capture coupled to oligonucleotide capture of regions of interest, such as gene promoters. Chromatin loop detection is challenging because existing Hi-C/4C-like tools, which make different assu...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Genome Biol
Main Authors: Ben Zouari, Yousra, Molitor, Anne M., Sikorska, Natalia, Pancaldi, Vera, Sexton, Tom
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2019
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6532271/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31118054
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/s13059-019-1706-3
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