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MAGNAMWAR: an R package for genome-wide association studies of bacterial orthologs

SUMMARY: Here we report on an R package for genome-wide association studies of orthologous genes in bacteria. Before using the software, orthologs from bacterial genomes or metagenomes are defined using local or online implementations of OrthoMCL. These presence–absence patterns are statistically as...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Main Authors: Sexton, Corinne E, Smith, Hayden Z, Newell, Peter D, Douglas, Angela E, Chaston, John M
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2018
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5972563/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29342236
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty001
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