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scHiCNorm: a software package to eliminate systematic biases in single-cell Hi-C data

SUMMARY: We build a software package scHiCNorm that uses zero-inflated and hurdle models to remove biases from single-cell Hi-C data. Our evaluations prove that our models can effectively eliminate systematic biases for single-cell Hi-C data, which better reveal cell-to-cell variances in terms of ch...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Main Authors: Liu, Tong, Wang, Zheng
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2018
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5860379/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29186290
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btx747
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