Long-read ChIA-PET for base-pair resolution mapping of haplotype-specific chromatin interactions

Chromatin Interaction Analysis by Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) is a robust method to capture genome-wide chromatin interactions. Unlike other 3C-based methods, it includes a chromatin immunoprecipitation (ChIP) step that enriches for interactions mediated by specific target proteins. This un...

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Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Nat Protoc
Hauptverfasser: Li, Xingwang, Luo, Oscar Junhong, Wang, Ping, Zheng, Meizhen, Wang, Danjuan, Piecuch, Emaly, Zhu, Jacqueline Jufen, Tian, Simon Zhongyuan, Tang, Zhonghui, Li, Guoliang, Ruan, Yijun
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: 2017
Schlagworte:
Article
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5537732/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28358394
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/nprot.2017.012
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