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Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs

MOTIVATION: New long read sequencing technologies, like PacBio SMRT and Oxford NanoPore, can produce sequencing reads up to 50 000 bp long but with an error rate of at least 15%. Reducing the error rate is necessary for subsequent utilization of the reads in, e.g. de novo genome assembly. The error...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Main Authors: Salmela, Leena, Walve, Riku, Rivals, Eric, Ukkonen, Esko
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2017
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5351550/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27273673
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw321
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