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Using nearly full-genome HIV sequence data improves phylogeny reconstruction in a simulated epidemic

HIV molecular epidemiology studies analyse viral pol gene sequences due to their availability, but whole genome sequencing allows to use other genes. We aimed to determine what gene(s) provide(s) the best approximation to the real phylogeny by analysing a simulated epidemic (created as part of the P...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Sci Rep
Hauptverfasser: Yebra, Gonzalo, Hodcroft, Emma B., Ragonnet-Cronin, Manon L., Pillay, Deenan, Brown, Andrew J. Leigh
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: Nature Publishing Group 2016
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5180198/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28008945
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1038/srep39489
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