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qsubsec: a lightweight template system for defining sun grid engine workflows

Summary: The Sun Grid Engine (SGE) high-performance computing batch queueing system is commonly used in bioinformatics analysis. Creating re-usable scripts for the SGE is a common challenge. The qsubsec template language and interpreter described here allow researchers to easily create generic templ...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Bioinformatics
Autor principal: Droop, Alastair P.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2016
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4824124/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26635140
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btv698
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