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A new set of atomic radii for accurate estimation of solvation free energy by Poisson–Boltzmann solvent model

The Poisson–Boltzmann implicit solvent (PB) is widely used to estimate the solvation free energies of biomolecules in molecular simulations. An optimized set of atomic radii (PB radii) is an important parameter for PB calculations, which determines the distribution of dielectric constants around the...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:J Comput Chem
Hauptverfasser: Yamagishi, Junya, Okimoto, Noriaki, Morimoto, Gentaro, Taiji, Makoto
Format: Artigo
Sprache:Inglês
Veröffentlicht: BlackWell Publishing Ltd 2014
Schlagworte:
Online Zugang:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4263261/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25220475
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1002/jcc.23728
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