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Fast algorithms for approximate circular string matching

BACKGROUND: Circular string matching is a problem which naturally arises in many biological contexts. It consists in finding all occurrences of the rotations of a pattern of length m in a text of length n. There exist optimal average-case algorithms for exact circular string matching. Approximate ci...

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Detalhes bibliográficos
Publicado no:Algorithms Mol Biol
Main Authors: Barton, Carl, Iliopoulos, Costas S, Pissis, Solon P
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BioMed Central 2014
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4234210/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24656145
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1186/1748-7188-9-9
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