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Selecting the Right Similarity-Scoring Matrix

Protein sequence similarity searching programs like BLASTP, SSEARCH (UNIT 3.10), and FASTA use scoring matrices that are designed to identify distant evolutionary relationships (BLOSUM62 for BLAST, BLOSUM50 for SEARCH and FASTA). Different similarity scoring matrices are most effective at different...

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Detalhes bibliográficos
Autor principal: Pearson, William R.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: 2013
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3848038/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24509512
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1002/0471250953.bi0305s43
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