تحميل...

Depth: a web server to compute depth, cavity sizes, detect potential small-molecule ligand-binding cavities and predict the pK(a) of ionizable residues in proteins

Residue depth accurately measures burial and parameterizes local protein environment. Depth is the distance of any atom/residue to the closest bulk water. We consider the non-bulk waters to occupy cavities, whose volumes are determined using a Voronoi procedure. Our estimation of cavity sizes is sta...

وصف كامل

محفوظ في:
التفاصيل البيبلوغرافية
المؤلفون الرئيسيون: Tan, Kuan Pern, Nguyen, Thanh Binh, Patel, Siddharth, Varadarajan, Raghavan, Madhusudhan, M. S.
التنسيق: Artigo
اللغة:Inglês
منشور في: Oxford University Press 2013
الموضوعات:
الوصول للمادة أونلاين:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3692129/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23766289
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/nar/gkt503
الوسوم: إضافة وسم
لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!