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Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations

Motivation: Expression quantitative trait loci (eQTL) analysis links variations in gene expression levels to genotypes. For modern datasets, eQTL analysis is a computationally intensive task as it involves testing for association of billions of transcript-SNP (single-nucleotide polymorphism) pair. T...

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Detalhes bibliográficos
Autor principal: Shabalin, Andrey A.
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Oxford University Press 2012
Assuntos:
Acesso em linha:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3348564/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22492648
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts163
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