Roundup 2.0: enabling comparative genomics for over 1800 genomes

Summary: Roundup is an online database of gene orthologs for over 1800 genomes, including 226 Eukaryota, 1447 Bacteria, 113 Archaea and 21 Viruses. Orthologs are inferred using the Reciprocal Smallest Distance algorithm. Users may query Roundup for single-linkage clusters of orthologous genes based...

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Dettagli Bibliografici
Autori principali: DeLuca, Todd F., Cui, Jike, Jung, Jae-Yoon, St. Gabriel, Kristian Che, Wall, Dennis P.
Natura: Artigo
Lingua:Inglês
Pubblicazione: Oxford University Press 2012
Soggetti:
Applications Note
Accesso online:https://ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3289913/
https://ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22247275
https://ncbi.nlm.nih.govhttp://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bts006
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