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RefSeq database growth influences the accuracy of k-mer-based lowest common ancestor species identification

Abstract In order to determine the role of the database in taxonomic sequence classification, we examine the influence of the database over time on k-mer-based lowest common ancestor taxonomic classification. We present three major findings: the number of new species added to the NCBI RefSeq databas...

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Detalhes bibliográficos
Main Authors: Daniel J. Nasko, Sergey Koren, Adam M. Phillippy, Todd J. Treangen
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2018-10-01
Colecção:Genome Biology
Assuntos:
Acesso em linha:http://link.springer.com/article/10.1186/s13059-018-1554-6
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