De-biasing microbiome sequencing data: bacterial morphology-based correction of extraction bias and correlates of chimera formation

Abstract Introduction Microbiome amplicon sequencing data are distorted by multiple protocol-dependent biases from bacterial DNA extraction, contamination, sequence errors, and chimeras, hindering clinical microbiome applications. In particular, extraction bias is a major confounder in sequencing-ba...

Πλήρης περιγραφή

Λεπτομέρειες βιβλιογραφικής εγγραφής

Κύριοι συγγραφείς:	Luise Rauer, Amedeo De Tomassi, Christian L. Müller, Claudia Hülpüsch, Claudia Traidl-Hoffmann, Matthias Reiger, Avidan U. Neumann
Μορφή:	Artigo
Γλώσσα:	Inglês
Έκδοση:	BMC 2025-02-01
Σειρά:	Microbiome
Θέματα:	Bacterial mock community Positive control Extraction bias Cell lysis Kitome Contamination
Διαθέσιμο Online:	https://doi.org/10.1186/s40168-024-01998-4
Ετικέτες:	Προσθήκη ετικέτας Δεν υπάρχουν, Καταχωρήστε ετικέτα πρώτοι!