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COPLA, a taxonomic classifier of plasmids

Abstract Background Plasmids are mobile genetic elements, key in the dissemination of antibiotic resistance, virulence determinants and other adaptive traits in bacteria. Obtaining a robust method for plasmid classification is necessary to better understand the genetics and epidemiology of many path...

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Principais autores: Santiago Redondo-Salvo, Roger Bartomeus-Peñalver, Luis Vielva, Kaitlin A. Tagg, Hattie E. Webb, Raúl Fernández-López, Fernando de la Cruz
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2021-07-01
coleção:BMC Bioinformatics
Assuntos:
Horizontal gene transfer
Plasmid
Antibiotic resistance genes
Average nucleotide identity
Plasmid epidemiology
Acesso em linha:https://doi.org/10.1186/s12859-021-04299-x
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