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Analysis and comprehensive comparison of PacBio and nanopore-based RNA sequencing of the Arabidopsis transcriptome

Abstract Background The number of studies using third-generation sequencing utilising Pacific Biosciences (PacBio) and Oxford Nanopore Technologies (ONT) is rapidly increasing in many different research areas. Among them, plant full-length single-molecule transcriptome studies have mostly used PacBi...

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Principais autores: Jiawen Cui, Nan shen, Zhaogeng Lu, Guolu Xu, Yuyao Wang, Biao Jin
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: BMC 2020-06-01
coleção:Plant Methods
Assuntos:
Plant transcriptome
Third-generation sequencing
PacBio
Nanopore
RNA-Seq
Single-molecule sequencing
Acesso em linha:http://link.springer.com/article/10.1186/s13007-020-00629-x
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