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Protocol for mapping 2′-O-methylation using nanopore direct RNA-seq data with NanoNm

Summary: 2'-O-methylation (Nm) is pivotal in rRNA and the internal site of mRNA. Here, we present an integrated bioinformatics protocol for the identification of 2′-O-methylation using nanopore direct RNA sequencing (RNA-seq) data. We describe steps for software installation, data collection, and tr...

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Principais autores: Yanqiang Li, Jiayi Chen, Yunxia Wang, Dean Li, Jiahan Li, Yang Yi, Lili Zhang, Qi Cao, Kaifu Chen
Formato: Artigo
Idioma:Inglês
Publicado em: Elsevier 2025-09-01
coleção:STAR Protocols
Assuntos:
Bioinformatics
Genomics
RNA-seq
Acesso em linha:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166725004095
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