Transcriptome assembly from long-read RNA-seq alignments with StringTie2

Abstract RNA sequencing using the latest single-molecule sequencing instruments produces reads that are thousands of nucleotides long. The ability to assemble these long reads can greatly improve the sensitivity of long-read analyses. Here we present StringTie2, a reference-guided transcriptome asse...

Бүрэн тодорхойлолт

Номзүйн дэлгэрэнгүй

Үндсэн зохиолчид:	Sam Kovaka, Aleksey V. Zimin, Geo M. Pertea, Roham Razaghi, Steven L. Salzberg, Mihaela Pertea
Формат:	Artigo
Хэл сонгох:	Inglês
Хэвлэсэн:	BMC 2019-12-01
Цуврал:	Genome Biology
Нөхцлүүд:	Transcriptome assembly RNA-seq Long-read sequencing Gene expression
Онлайн хандалт:	https://doi.org/10.1186/s13059-019-1910-1
Шошгууд:	Шошго нэмэх Шошго байхгүй, Энэхүү баримтыг шошголох эхний хүн болох!